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プログラムと検索するデータベースを選んで下さい:
プログラム:
blastn
blastp
blastx
tblastn
tblastx
データベース:
塩基配列データベース
H-Inv完全長cDNA
H-Inv全転写物
アミノ酸配列データベース
H-Inv完全長cDNA（CDS）
H-Inv全転写物（CDS）
FASTA
形式での配列の入力
ディスクからの読みこみ
デフォルトでは
フィルター
がONになっており、相同性を判断するのにあまり意味がない配列は無効化されます。
フィルター
低複雑配列のマスク
"lookup table" 作成時のみ
期待値
0.0001
0.01
1
10
100
1000
アミノ酸置換テーブル
PAM30
PAM70
BLOSUM80
BLOSUM62
BLOSUM45
ギャップ無しの計算
コドン表
Standard (1)
Vertebrate Mitochondrial (2)
Yeast Mitochondrial (3)
Mold Mitochondrial; ... (4)
Invertebrate Mitochondrial (5)
Ciliate Nuclear; ... (6)
Echinoderm Mitochondrial (9)
Euplotid Nuclear (10)
Bacterial (11)
Alternative Yeast Nuclear (12)
Ascidian Mitochondrial (13)
Flatworm Mitochondrial (14)
Blepharisma Macronuclear (15)
フレームシフトペナルティ
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
25
30
50
1000
No OOF
その他のオプション:
アラインメント結果のグラフィカル表示
アラインメント表示方法
Pairwise
master-slave with identities
master-slave without identities
flat master-slave with identities
flat master-slave without identities
BLAST XML
Hit Table
簡易結果の表示件数
0
10
50
100
250
500
アラインメントの表示件数
0
10
50
100
250
500
色彩のスキーマ
No color schema
Color schema 1
Color schema 2
Color schema 3
Color schema 4
Color schema 5
Color schema 6