データと解析方法
データリソース
- ヒト: 転写物（完全長cDNA）: 配列プロバイダー, （mRNA）: H-InvDB 7.5 (DDBJ 78), ゲノム: UCSC hg19, SNP: dbSNP 130
- マウス: 転写物（完全長cDNA）: 配列プロバイダー, （mRNA）: H-InvDB 6.2 (DDBJ 73), ゲノム: UCSC mm9
- ラット: 転写物（RNA）: H-InvDB 5.3 (DDBJ 69) + RefSeq 23 + Ensembl 44, ゲノム: UCSC rn4
- チンパンジー: 転写物（RNA）: H-InvDB 5.3 (DDBJ 69) + RefSeq 23 + Ensembl 44, ゲノム: UCSC pt2
- アカゲザル: 転写物（RNA）: H-InvDB 5.3 (DDBJ 69) + RefSeq 23 + Ensembl 44, ゲノム: UCSC rm2
- イヌ: 転写物（RNA）: H-InvDB 5.3 (DDBJ 69) + RefSeq 23 + Ensembl 44, ゲノム: UCSC cf2
マッピングとクラスタリングのパイプライン（H-InvDBのヘルプより）
ORFの予測（H-InvDBのヘルプより）
不完全転写物の判定
代表ASバリアント（RASV）の判定
RASVの比較ゲノム解析
