bases per tick :
2000
1000
500
200
100
50
20
10
5
2
kb first site :
homology :
C.familiaris
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
ENSCAFT00000025541
genome : 41,477,998 - 41,513,108 (35,111)
query : 1 - 3,379 (3,379/3,379)
22 exons
identity = 0.998
5'(0.988;0.959;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSCAFT00000025552
genome : 41,477,998 - 41,489,210 (11,213)
query : 1 - 630 (630/630)
5 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_547506
genome : 41,478,004 - 41,513,415 (35,412)
query : 1 - 3,671 (3,671/3,671)
22 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000)3'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_858683
genome : 41,478,004 - 41,513,415 (35,412)
query : 1 - 3,683 (3,683/3,683)
22 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000)3'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_858704
Representative transcript
genome : 41,478,004 - 41,513,415 (35,412)
query : 1 - 3,698 (3,698/3,698)
22 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000)3'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000384784
Pan
sp. (Chimpanzee) : XR_023240
Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000000176
Macaca
sp. (Macaque) : AB171818
Mus
sp. (Mouse) : AK169326
Rattus
sp. (Rat) : BC085765
Equus
sp. (Horse) : XM_001491457
Bos
sp. (Cow) : D90073
Monodelphis
sp. (Opossum) : ENSMODT00000007685
Gallus
sp. (Chicken) : X52690
Danio
sp. (Zebrafish) : BC100001
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000017177
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00030380001
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000181211
XM_858728
genome : 41,478,004 - 41,513,415 (35,412)
query : 1 - 3,674 (3,674/3,674)
22 exons
identity = 1.000
5'(1.000;0.991;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000)3'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSCAFT00000033798
Representative transcript
genome : 41,492,617 - 41,492,743 (127)
query : 1 - 127 (127/127)
1 exon
identity = 1.000
3'(1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
contig_26214
41475709-41515708 W +