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HIX0170799
HIT000524819 ( ENST00000426885 )
  (Conserved hypothetical protein.)
  genome : 55,526,160 - 55,526,374 (215)
  query : 1 - 215 (215/215)
  1 exon
  identity = 1.000
  5'(1.000)3'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    SOLUBLE PROTEIN
  PSORT :
    extr 20, cyto_nucl 5.5, cyto 4.5, nucl 3.5, mito 3
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0170799)

HIX0218901
HIT000580286 ( ENST00000476074 )
  (Conserved hypothetical protein.)
  genome : 55,566,746 - 55,578,144 (11,399)
  query : 1 - 754 (754/754)
  5 exons
  identity = 1.000
  3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    SOLUBLE PROTEIN
  PSORT :
    cyto_nucl 13, cyto 12.5, nucl 10.5, extr 9
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0218901)

HIX0218901
HIT000430106 ( AK311240 )
  Representative transcript
  (Hypothetical short protein.)
  genome : 55,576,775 - 55,577,935 (1,161)
  query : 1 - 1,161 (1,161/1,161)
  1 exon
  identity = 0.997
  3'(0.997)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    extr 15, cyto 12, nucl 3
  H-InvDB(Transcript view)
  H-InvDB(Locus view)
  DDBJ
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0218901)

HIX0218844
HIT000083325_02 ( AY029205 )
  Representative transcript
  (Protocadherin-15; Precursor;)
  genome : 55,581,053 - 56,561,039 (979,987)
  query : 1 - 6,816 (6,816/6,843)
  32 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;1.000;0.978;0.994;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;0.991;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;0.985;
      1.000;1.000;1.000;0.994;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  InterPro :
    IPR002126 : Cadherin
    IPR015919 : Cadherin-like
    IPR020894 : Cadherin conserved site
  GO :
    0005509 : Molecular Function : calcium ion binding
    0005886 : Cellular Component : plasma membrane
    0007155 : Biological Process : cell adhesion
    0007156 : Biological Process : homophilic cell adhesion
    0016020 : Cellular Component : membrane
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 28, E.R. 2, pero 2
  H-InvDB(Transcript view)
  H-InvDB(Locus view)
  DDBJ
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0218844)

HIX0218844
HIT000253461 ( AY388963 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
  genome : 55,581,036 - 55,666,977 (85,942)
  query : 1 - 3,469 (3,469/3,469)
  9 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;1.000;0.978;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  InterPro :
    IPR002126 : Cadherin
    IPR015919 : Cadherin-like
  GO :
    0005509 : Molecular Function : calcium ion binding
    0007156 : Biological Process : homophilic cell adhesion
    0016020 : Cellular Component : membrane
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    cyto 14, cyto_nucl 11.3333, cyto_mito 8.83333,
    nucl 7.5, plas 5.5, extr_plas 3.5
  H-InvDB(Transcript view)
  H-InvDB(Locus view)
  DDBJ
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0218844)

HIX0218844
HIT000567904 ( ENST00000463095 )
  (Cadherin domain containing protein.)
  genome : 55,581,036 - 55,666,977 (85,942)
  query : 1 - 3,469 (3,469/3,469)
  9 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;1.000;0.978;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    cyto 14, cyto_nucl 11.3333, cyto_mito 8.83333,
    nucl 7.5, plas 5.5, extr_plas 3.5
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0218844)

HIX0218844
HIT000028865 ( AL834134 )
  (Protocadherin-15 isoform CD2-2 precursor.)
  genome : 55,754,341 - 56,560,948 (806,608)
  query : 1 - 4,228 (4,228/4,244)
  21 exons
  identity = 0.999
  3'(0.996;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;0.995;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  InterPro :
    IPR002126 : Cadherin
    IPR015919 : Cadherin-like
    IPR020894 : Cadherin conserved site
  GO :
    0005509 : Molecular Function : calcium ion binding
    0005886 : Cellular Component : plasma membrane
    0007155 : Biological Process : cell adhesion
    0007156 : Biological Process : homophilic cell adhesion
    0016020 : Cellular Component : membrane
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    pero 9, E.R. 7, extr 6, E.R._golg 6, golg 5,
    mito_pero 5
  H-InvDB(Transcript view)
  H-InvDB(Locus view)
  DDBJ
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0218844)

HIX0218844
HIT000355235 ( ENST00000373955 )
  (Cadherin domain containing protein.)
  genome : 55,754,339 - 56,560,948 (806,610)
  query : 1 - 4,230 (4,230/4,230)
  21 exons
  identity = 1.000
  3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    pero 9, E.R. 7, extr 6, E.R._golg 6, golg 5,
    mito_pero 5
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0218844)

HIX0218844
HIT000556572 ( ENST00000458638 )
  (Conserved hypothetical protein.)
  genome : 56,138,583 - 56,926,420 (787,838)
  query : 9 - 448 (440/448)
  5 exons
  identity = 0.995
  3'(1.000;1.000;1.000;1.000;0.976)5'
  coverage = 0.982
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    extr 30
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0218844)

HIX0035597
HIT000096108 ( BC040305 )
  Representative transcript
  (Conserved hypothetical protein.)
  genome : 56,245,990 - 56,415,811 (169,822)
  query : 1 - 2,301 (2,301/2,317)
  6 exons
  identity = 0.998
  5'(1.000;1.000;0.998;1.000;1.000;0.998)3'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    SOLUBLE PROTEIN
  PSORT :
    nucl 13, extr 11, mito 7, cyto_nucl 7
  H-InvDB(Transcript view)
  H-InvDB(Locus view)
  DDBJ
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0035597)

HIX0035597
HIT000520776 ( ENST00000422842 )
  (Conserved hypothetical protein.)
  genome : 56,245,990 - 56,415,811 (169,822)
  query : 1 - 2,300 (2,300/2,300)
  6 exons
  identity = 1.000
  5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)3'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    SOLUBLE PROTEIN
  PSORT :
    nucl 13, extr 11, mito 7, cyto_nucl 7
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0035597)

HIX0171041
HIT000541357 ( ENST00000443423 )
  (Conserved hypothetical protein.)
  genome : 56,359,438 - 56,360,443 (1,006)
  query : 1 - 1,006 (1,006/1,006)
  1 exon
  identity = 1.000
  5'(1.000)3'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    SOLUBLE PROTEIN
  PSORT :
    nucl 17, cyto 13
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0171041)

HIX0170635
HIT000512229 ( ENST00000414295 )
  (Non-protein coding transcript.)
  genome : 56,624,434 - 56,628,882 (4,449)
  query : 1 - 207 (207/207)
  2 exons
  identity = 1.000
  3'(1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0170635)

HIX0171251
HIT000555909 ( ENST00000457975 )
  (Conserved hypothetical protein.)
  genome : 57,007,508 - 57,356,993 (349,486)
  query : 1 - 446 (446/446)
  4 exons
  identity = 1.000
  3'(1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    SOLUBLE PROTEIN
  PSORT :
    extr 15, cyto_nucl 8, nucl 6, cyto 6, mito 5
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0171251)

HIX0170528
HIT000460506_11 ( DQ593975 )
  Representative transcript
  (Non-protein coding transcript.)
  genome : 57,025,892 - 57,025,921 (30)
  query : 1 - 30 (30/30)
  1 exon
  identity = 0.967
  3'(0.967)5'
  coverage = 1.000
  H-InvDB(Transcript view)
  H-InvDB(Locus view)
  DDBJ
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0170528)

HIX0008835
HIT000355245 ( ENST00000373965 )
  (Protocadherin-15 isoform CD3-2 precursor.)
  genome : 55,562,531 - 56,561,051 (998,521)
  query : 1 - 9,258 (9,258/9,258)
  34 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;1.000;0.988;0.978;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 25, lyso 3, E.R. 2, pero 2
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000512712 ( ENST00000414778 )
  (Protocadherin-15 isoform CD3-2 precursor.)
  genome : 55,562,531 - 56,561,051 (998,521)
  query : 1 - 9,249 (9,249/9,249)
  33 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;0.925;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 24, pero 3, lyso 3
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000560759 ( NM_001142771 )
  (Protocadherin-15 isoform CD3-1 precursor.)
  genome : 55,562,531 - 56,561,051 (998,521)
  query : 1 - 9,252 (9,252/9,252)
  33 exons
  identity = 0.998
  3'(1.000;1.000;0.988;0.978;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;0.925;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 24, pero 3, lyso 3
  RefSeq
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000560760 ( NM_001142772 )
  (Protocadherin-15 isoform CD3-2 precursor.)
  genome : 55,562,531 - 56,561,051 (998,521)
  query : 1 - 9,237 (9,237/9,237)
  33 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;1.000;0.988;0.978;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 24, pero 3, lyso 3
  RefSeq
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000645524 ( EU718482 )
  (Protocadherin-15 isoform CD3-2 precursor.)
  genome : 55,565,916 - 56,561,051 (995,136)
  query : 1 - 5,846 (5,846/5,846)
  33 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;1.000;1.000;0.978;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  InterPro :
    IPR002126 : Cadherin
    IPR015919 : Cadherin-like
    IPR020894 : Cadherin conserved site
  GO :
    0005509 : Molecular Function : calcium ion binding
    0005886 : Cellular Component : plasma membrane
    0007155 : Biological Process : cell adhesion
    0007156 : Biological Process : homophilic cell adhesion
    0016020 : Cellular Component : membrane
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 24, pero 3, lyso 3
  H-InvDB(Transcript view)
  H-InvDB(Locus view)
  DDBJ
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000598846 ( ENST00000495484 )
  (Conserved hypothetical protein.)
  genome : 55,566,085 - 56,561,051 (994,967)
  query : 1 - 1,896 (1,896/1,896)
  9 exons
  identity = 1.000
  3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    SOLUBLE PROTEIN
  PSORT :
    extr 20, nucl 5, cyto 4, cyto_pero 3.5
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000478810 ( ENST00000395438 )
  (Protocadherin-15 isoform CD2-2 precursor.)
  genome : 55,568,211 - 56,561,051 (992,841)
  query : 1 - 6,044 (6,044/6,044)
  34 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;1.000;1.000;0.988;0.978;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 28, E.R. 2, pero 2
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000507859 ( ENST00000409834 )
  (Protocadherin-15 isoform CD2-2 precursor.)
  genome : 55,568,211 - 56,561,051 (992,841)
  query : 1 - 5,058 (5,058/5,058)
  27 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;1.000;1.000;0.988;0.978;1.000;1.000;
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      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    cyto 10, E.R. 7, mito 5.5, cyto_plas 5.5,
    mito_pero 4.5, extr 4
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000645522 ( EU718480 )
  (Protocadherin-15 isoform CD2-2 precursor.)
  genome : 55,568,282 - 56,561,051 (992,770)
  query : 1 - 5,917 (5,917/5,917)
  34 exons
  identity = 0.999
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  InterPro :
    IPR002126 : Cadherin
    IPR015919 : Cadherin-like
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  GO :
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    0016020 : Cellular Component : membrane
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 25, lyso 3, E.R. 2, pero 2
  H-InvDB(Transcript view)
  H-InvDB(Locus view)
  DDBJ
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000645523 ( EU718481 )
  (Protocadherin-15 isoform CD2-1 precursor.)
  genome : 55,568,282 - 56,561,051 (992,770)
  query : 1 - 5,988 (5,988/5,988)
  34 exons
  identity = 0.998
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  coverage = 1.000
  InterPro :
    IPR002126 : Cadherin
    IPR015919 : Cadherin-like
    IPR020894 : Cadherin conserved site
  GO :
    0005509 : Molecular Function : calcium ion binding
    0005886 : Cellular Component : plasma membrane
    0007155 : Biological Process : cell adhesion
    0007156 : Biological Process : homophilic cell adhesion
    0016020 : Cellular Component : membrane
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 25, lyso 3, E.R. 2, pero 2
  H-InvDB(Transcript view)
  H-InvDB(Locus view)
  DDBJ
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000478812 ( ENST00000395440 )
  (Protocadherin-15 isoform CD2-1 precursor.)
  genome : 55,568,343 - 56,561,051 (992,709)
  query : 1 - 2,664 (2,664/2,664)
  12 exons
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  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
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  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000478814 ( ENST00000395442 )
  (Protocadherin-15 isoform CD3-1 precursor.)
  genome : 55,568,343 - 56,561,051 (992,709)
  query : 1 - 2,457 (2,457/2,457)
  11 exons
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  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
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  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000478817 ( ENST00000395445 )
  (Protocadherin-15 isoform CD2-2 precursor.)
  genome : 55,568,343 - 56,561,051 (992,709)
  query : 1 - 5,862 (5,862/5,862)
  34 exons
  identity = 0.999
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      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
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  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 25, lyso 3, E.R. 2, pero 2
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000478818 ( ENST00000395446 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
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  18 exons
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  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    E.R. 11, extr 9, plas 5, lyso 3, nucl 1, mito 1,
    pero 1, golg 1, mito_pero 1, mito_nucl 1
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000512301 ( ENST00000414367 )
  (Protocadherin-15 isoform CD2-1 precursor.)
  genome : 55,568,343 - 56,561,051 (992,709)
  query : 1 - 2,905 (2,905/2,905)
  13 exons
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  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    extr 14, golg 7, pero 6, lyso 3, mito_pero 3,
    cyto_pero 3
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000560757 ( NM_001142769 )
  (Protocadherin-15 isoform CD2-1 precursor.)
  genome : 55,568,452 - 56,561,051 (992,600)
  query : 1 - 5,768 (5,768/5,768)
  34 exons
  identity = 0.997
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  coverage = 1.000
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    MEMBRANE PROTEIN
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  RefSeq
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000560758 ( NM_001142770 )
  (Protocadherin-15 isoform CD2-2 precursor.)
  genome : 55,568,452 - 56,561,051 (992,600)
  query : 1 - 5,803 (5,803/5,803)
  34 exons
  identity = 0.999
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  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 28, E.R. 2, pero 2
  RefSeq
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000211104 ( NM_033056 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
  genome : 55,580,860 - 56,561,051 (980,192)
  query : 1 - 7,021 (7,021/7,021)
  32 exons
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  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 28, E.R. 2, pero 2
  RefSeq
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000478804 ( ENST00000395432 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
  genome : 55,580,860 - 56,561,051 (980,192)
  query : 1 - 6,901 (6,901/6,901)
  31 exons
  identity = 1.000
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  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
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  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000560751 ( NM_001142763 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
  genome : 55,580,860 - 56,561,051 (980,192)
  query : 1 - 7,042 (7,042/7,042)
  32 exons
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      1.000;1.000;0.925;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 28, E.R. 2, pero 2
  RefSeq
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000560752 ( NM_001142764 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
  genome : 55,580,860 - 56,561,051 (980,192)
  query : 1 - 7,027 (7,027/7,027)
  32 exons
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  SOSUI :
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  PSORT :
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  RefSeq
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000560753 ( NM_001142765 )
  (Protocadherin-15 isoform CD1-6 precursor.)
  genome : 55,580,860 - 56,561,051 (980,192)
  query : 1 - 6,814 (6,814/6,814)
  30 exons
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    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
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  RefSeq
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000560754 ( NM_001142766 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
  genome : 55,580,860 - 56,561,051 (980,192)
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  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
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  (Protocadherin-15; Precursor;)
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  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
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  (Protocadherin-15; Precursor;)
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  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 28, E.R. 2, pero 2
  RefSeq
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000560761 ( NM_001142773 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
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  3'(1.000;0.988;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 27, E.R. 2, pero 2
  RefSeq
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000315101 ( ENST00000361849 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
  genome : 55,580,930 - 56,561,051 (980,122)
  query : 1 - 6,957 (6,957/6,957)
  32 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;0.988;0.978;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 28, E.R. 2, pero 2
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000478805 ( ENST00000395433 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
  genome : 55,580,930 - 56,561,051 (980,122)
  query : 1 - 6,882 (6,882/6,882)
  31 exons
  identity = 1.000
  3'(1.000;0.988;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 27, E.R. 2, pero 2
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000046796 ( AK126923 )
  (Protocadherin-15 isoform CD1-10 precursor.)
  genome : 55,580,939 - 57,387,702 (1,806,764)
  query : 1 - 3,471 (3,471/3,471)
  21 exons
  identity = 0.999
  3'(0.997;0.992;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  InterPro :
    IPR002126 : Cadherin
    IPR015919 : Cadherin-like
    IPR020894 : Cadherin conserved site
  GO :
    0005509 : Molecular Function : calcium ion binding
    0005886 : Cellular Component : plasma membrane
    0007155 : Biological Process : cell adhesion
    0007156 : Biological Process : homophilic cell adhesion
    0016020 : Cellular Component : membrane
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    pero 10, E.R. 6, extr 5, golg 5, cyto_pero 5
  H-InvDB(Transcript view)
  H-InvDB(Locus view)
  DDBJ
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000355237 ( ENST00000373957 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
  genome : 55,580,939 - 57,387,702 (1,806,764)
  query : 1 - 3,471 (3,471/3,471)
  21 exons
  identity = 1.000
  3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    pero 8, E.R. 7, golg 7, E.R._golg 7
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000122374 ( ENST00000320301 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
  genome : 55,581,036 - 56,561,051 (980,016)
  query : 1 - 6,845 (6,845/6,845)
  32 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;1.000;0.978;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 28, E.R. 2, pero 2
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000355236 ( ENST00000373956 )
  (Protocadherin-15 isoform CD1-10 precursor.)
  genome : 55,581,036 - 56,561,051 (980,016)
  query : 1 - 5,158 (5,158/5,158)
  20 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;0.988;0.978;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    pero 13, cyto 9, E.R._mito 4, plas 3, mito 2.5,
    E.R. 2.5
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000478802 ( ENST00000395430 )
  (Protocadherin-15; Precursor;)
  genome : 55,581,036 - 56,561,051 (980,016)
  query : 1 - 6,836 (6,836/6,836)
  32 exons
  identity = 1.000
  3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 28, E.R. 2, pero 2
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000546819 ( ENST00000448885 )
  (Protocadherin-15 isoform CD1-9 precursor.)
  genome : 55,581,036 - 56,561,051 (980,016)
  query : 1 - 6,771 (6,771/6,771)
  31 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;0.988;0.978;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    pero 11, golg 7, E.R. 5, extr 4, lyso 4
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
  cDNA Multiple Alignment
    (HIX0008835)

HIX0008835
HIT000534943 ( ENST00000437009 )
  (Protocadherin-15 isoform CD1-7 precursor.)
  genome : 55,581,618 - 56,561,051 (979,434)
  query : 1 - 6,056 (6,056/6,056)
  30 exons
  identity = 0.999
  3'(1.000;0.981;0.974;1.000;1.000;1.000;1.000;
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      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
      1.000;1.000)5'
  coverage = 1.000
  SOSUI :
    MEMBRANE PROTEIN
  PSORT :
    plas 28, E.R. 2, pero 2
  Ensembl
  cDNA-genome Alignment
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    (HIX0008835)

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homology : UCSC CCDS Pseudogene.org Conserved regions ( Segmental duplication P.troglodytes P.abelii M.mulatta M.musculus R.norvegicus C.familiaris E.caballus B.taurus M.domestica G.gallus D.rerio O.latipes T.nigroviridis T.rubripes )
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