bases per tick :
500
200
100
50
20
10
5
2
kb first site :
main :
All Human Genes
JIGSAW prediction
ESTs assembly
homology :
UCSC
CCDS
Pseudogene.org
Conserved regions (
Segmental duplication
P.troglodytes
P.abelii
M.mulatta
M.musculus
R.norvegicus
C.familiaris
E.caballus
B.taurus
M.domestica
G.gallus
D.rerio
O.latipes
T.nigroviridis
T.rubripes
)
gene prediction :
FGENESH
GenScan
HMMgene
tRNA
show... :
SNPs
ESTs(summary)
ESTs(detail)
CAGE tag(summary)
CAGE tag(detail)
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
HIX0204494
HIT000465211_12
(
DQ598680
)
genome : 163,575,454 - 163,575,483 (30)
query : 1 - 30 (30/30)
1 exon
identity = 1.000
5'(1.000)3'
coverage = 1.000
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0204494)
HIX0204771
HIT000587140 (
ENST00000483240
)
genome : 163,719,394 - 163,720,253 (860)
query : 1 - 860 (860/860)
1 exon
identity = 1.000
3'(1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0204771)
HIX0163527
HIT000506435 (
ENST00000408324
)
genome : 163,889,259 - 163,889,344 (86)
query : 1 - 86 (86/86)
1 exon
identity = 1.000
3'(1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0163527)
HIX0163527
HIT000658580 (
NR_031665
)
genome : 163,889,259 - 163,889,344 (86)
query : 1 - 86 (86/86)
1 exon
identity = 1.000
3'(1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0163527)
HIX0204816
HIT000590505 (
ENST00000486767
)
genome : 164,388,666 - 164,403,864 (15,199)
query : 1 - 576 (576/576)
4 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0204816)
HIX0204348
HIT000568749 (
ENST00000463978
)
genome : 164,431,883 - 164,448,824 (16,942)
query : 1 - 553 (553/553)
2 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0204348)
HIX0204348
HIT000600658 (
ENST00000497379
)
genome : 164,431,889 - 164,549,268 (117,380)
query : 1 - 838 (838/838)
4 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0204348)
HIX0030867
HIT000198047 (
NM_001041
)
genome : 164,696,686 - 164,796,283 (99,598)
query : 1 - 6,011 (6,011/6,023)
48 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0030867
HIT000322607
(
X63597
)
genome : 164,696,686 - 164,796,282 (99,597)
query : 1 - 6,010 (6,010/6,021)
48 exons
identity = 0.999
3'(1.000;0.994;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;0.993;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;0.991;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;0.992;1.000)5'
coverage = 1.000
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0030867
HIT000109290 (
ENST00000264382
)
genome : 164,696,686 - 164,796,283 (99,598)
query : 1 - 6,011 (6,011/6,011)
48 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0030867
HIT000390887
(
BC132834
)
genome : 164,697,059 - 164,796,276 (99,218)
query : 1 - 5,631 (5,631/5,631)
48 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;0.971;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;0.992;1.000)5'
coverage = 1.000
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0030867
HIT000390913
(
BC132860
)
genome : 164,697,060 - 164,796,276 (99,217)
query : 1 - 5,630 (5,630/5,630)
48 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;0.971;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;0.992;1.000)5'
coverage = 1.000
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0030867
HIT000340796
(
BC115034
)
genome : 164,697,090 - 164,796,280 (99,191)
query : 17 - 5,620 (5,604/5,635)
48 exons
identity = 0.998
3'(1.000;0.988;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;0.993;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;0.992;1.000;0.990;1.000;
1.000;1.000;0.994;0.994;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;0.991;0.988;1.000;1.000;
0.991;0.992;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;0.992;0.983)5'
coverage = 0.994
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0030867
HIT000340823
(
BC116453
)
genome : 164,697,090 - 164,796,280 (99,191)
query : 17 - 5,620 (5,604/5,635)
48 exons
identity = 0.999
3'(1.000;0.994;0.980;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;0.994;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;0.988;
1.000;1.000;1.000;1.000;0.992;1.000)5'
coverage = 0.994
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0030867
HIT000387344
(
BC115035
)
genome : 164,697,090 - 164,796,280 (99,191)
query : 17 - 5,620 (5,604/5,634)
48 exons
identity = 0.999
3'(1.000;0.994;1.000;0.989;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;0.991;1.000;0.994;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;0.989;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;0.991;1.000;1.000;
0.993;1.000;1.000;1.000;0.992;1.000)5'
coverage = 0.995
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0030867
HIT000387343
(
BC115033
)
genome : 164,697,090 - 164,796,280 (99,191)
query : 16 - 5,618 (5,603/5,632)
48 exons
identity = 0.999
3'(1.000;0.994;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;0.991;
0.984;1.000;1.000;0.992;1.000;1.000;1.000;
0.994;1.000;1.000;1.000;1.000;0.989;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;0.991;1.000;1.000;0.992;1.000)5'
coverage = 0.995
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0030867
HIT000340822
(
BC116452
)
genome : 164,697,090 - 164,796,280 (99,191)
query : 17 - 5,620 (5,604/5,633)
48 exons
identity = 0.999
3'(0.992;0.994;1.000;1.000;0.992;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;0.994;1.000;1.000;0.992;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;0.990;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;0.992;1.000)5'
coverage = 0.995
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0030867
HIT000194854
(
M22616
)
genome : 164,758,851 - 164,793,802 (34,952)
query : 4 - 2,041 (2,038/2,041)
17 exons
identity = 0.999
3'(1.000;0.991;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;0.992)5'
coverage = 0.999
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0030867
HIT000580781 (
ENST00000476593
)
genome : 164,786,507 - 164,796,283 (9,777)
query : 1 - 565 (565/565)
5 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0030867
HIT000568395 (
ENST00000463607
)
genome : 164,792,213 - 164,793,802 (1,590)
query : 1 - 363 (363/363)
2 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0030867)
HIX0020969
HIT000008316
(
AK025042
)
genome : 164,867,798 - 164,875,850 (8,053)
query : 1 - 1,943 (1,943/1,960)
2 exons
identity = 0.997
3'(0.997;1.000)5'
coverage = 1.000
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0020969)
HIX0020969
HIT000576513 (
ENST00000472120
)
genome : 164,867,794 - 164,875,850 (8,057)
query : 1 - 1,948 (1,948/1,948)
2 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0020969)
HIX0003827
HIT000096189
(
BC040491
)
genome : 164,904,509 - 164,913,572 (9,064)
query : 1 - 4,337 (4,337/4,414)
2 exons
identity = 0.998
3'(0.998;1.000)5'
coverage = 1.000
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0003827)
HIX0003827
HIT000205205 (
NM_014926
)
genome : 164,904,509 - 164,914,469 (9,961)
query : 1 - 4,221 (4,221/4,281)
2 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0003827)
HIX0003827
HIT000579634 (
ENST00000475390
)
genome : 164,904,508 - 164,913,790 (9,283)
query : 1 - 4,555 (4,555/4,555)
2 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0003827)
HIX0003827
HIT000105102 (
ENST00000241274
)
genome : 164,904,510 - 164,914,640 (10,131)
query : 1 - 4,391 (4,391/4,391)
2 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0003827)
HIX0003827
HIT000000565
(
AB020655
)
genome : 164,904,510 - 164,914,469 (9,960)
query : 1 - 4,220 (4,220/4,220)
2 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0003827)
HIX0003827
HIT000340763
(
BC114621
)
genome : 164,905,127 - 164,914,449 (9,323)
query : 6 - 3,588 (3,583/3,596)
2 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000)5'
coverage = 0.996
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0003827)
HIX0003827
HIT000422821
(
AK290024
)
genome : 164,905,318 - 164,913,790 (8,473)
query : 1 - 3,745 (3,745/3,745)
2 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
H-InvDB(Transcript view)
H-InvDB(Locus view)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0003827)
HIX0003827
HIT000600985 (
ENST00000497724
)
genome : 164,908,131 - 164,914,897 (6,767)
query : 1 - 585 (585/585)
2 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0003827)
HIX0204360
HIT000574626 (
ENST00000470138
)
genome : 164,924,748 - 165,298,816 (374,069)
query : 1 - 577 (577/577)
4 exons
identity = 1.000
5'(1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0204360)
HIX0204360
HIT000601829 (
ENST00000498616
)
genome : 164,924,750 - 165,209,054 (284,305)
query : 1 - 563 (563/563)
4 exons
identity = 1.000
5'(1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0204360)
HIX0204360
HIT000598299 (
ENST00000494915
)
genome : 164,924,769 - 165,178,321 (253,553)
query : 1 - 594 (594/594)
5 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
(HIX0204360)
AC112910.3
163500001-163604448 F +
NCBI
AC084017.14
163604449-163769550 F -
NCBI
AC018917.17
163769551-163809026 F -
NCBI
AC018457.14
163809027-163982357 F -
NCBI
AC117411.3
163982358-164104877 F -
NCBI
AC110989.3
164104878-164262273 F -
NCBI
AC084235.13
164262274-164433757 F -
NCBI
AC112908.3
164433758-164543026 F +
NCBI
AC117429.6
164543027-164589907 F +
NCBI
AC092695.8
164589908-164754372 F -
NCBI
AC144561.8
164754373-164789541 F +
NCBI
AC140119.3
164789542-164868429 F -
NCBI
AC013458.5
164868430-165079956 F +
NCBI
AC073289.12
165079957-165100000 F +
NCBI