bases per tick :
2000
1000
500
200
100
50
20
10
5
2
kb first site :
homology :
M.mulatta
H.sapiens
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
XR_011821
Representative transcript
genome : 31,373,382 - 31,448,988 (75,607)
query : 1 - 4,654 (4,654/4,654)
37 exons
identity = 0.998
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
0.933;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000100448
Pan
sp. (Chimpanzee) : XM_525729
Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000014543
Mus
sp. (Mouse) : AK144700
Rattus
sp. (Rat) : J05579
Canis
sp. (Dog) : XM_857565
Equus
sp. (Horse) : ENSECAT00000024524
Equus
sp. (Horse) : XM_001501558
Bos
sp. (Cow) : X83508
Monodelphis
sp. (Opossum) : XM_001380693
Gallus
sp. (Chicken) : D13221
Danio
sp. (Zebrafish) : BC091816
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000001340
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00012569001
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000173565
ENSMMUT00000000818
genome : 31,373,956 - 31,448,988 (75,033)
query : 1 - 3,987 (3,987/3,987)
35 exons
identity = 0.993
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;0.864;0.992;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSMMUT00000043640
genome : 31,373,956 - 31,448,988 (75,033)
query : 1 - 3,993 (3,993/3,993)
35 exons
identity = 0.991
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;0.882;0.928;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
HIT000100448
(
D11456
)
genome : 31,373,608 - 31,449,037 (75,430)
query : 9 - 4,388 (4,380/4,404)
35 exons
identity = 0.945
3'(0.905;0.983;0.968;1.000;0.974;0.981;1.000;
0.946;0.958;0.976;0.979;0.969;0.931;0.977;
0.948;0.968;0.979;0.992;0.944;0.971;0.952;
0.943;0.978;0.973;0.979;0.954;0.739;0.743;
0.913;1.000;0.976;1.000;0.979;0.983;0.923)5'
coverage = 0.998
H-InvDB(Advanced Search)
H-InvDB(Topic Annotation)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Evola CSM: cross-species mapping view
HIT000458302
(
DQ591771
)
genome : 31,415,238 - 31,415,267 (30)
query : 1 - 30 (30/30)
1 exon
identity = 0.967
3'(0.967)5'
coverage = 1.000
H-InvDB(Advanced Search)
H-InvDB(Topic Annotation)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Evola CSM: cross-species mapping view
HIT000049385
(
AK130114
)
genome : 31,416,911 - 31,436,363 (19,453)
query : 1 - 2,164 (2,164/2,164)
2 exons
identity = 0.899
5'(0.816;0.907)3'
coverage = 1.000
H-InvDB(Advanced Search)
H-InvDB(Topic Annotation)
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Evola CSM: cross-species mapping view
Contig
31371185-31451184 F +