"Human Full-Length cDNA Annotation Invitational"
(H-Invitational)
2002年8月25日-9月3日
- ヒト遺伝子の体系的な同定と生物学的な重要性-
協賛 生物情報解析研究センター（JBIRC）
国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ 研究センター（DDBJ/NIG）
H-Invitationalの目標
- cDNA配列アノテーションプロジェクトの国際的な運営
- 統一基準に基づき、人手によるアノテーション・修正を施した、高品質で他に類を見ないcDNAデータセットの収集
- 広く科学者へ向けた統合されたツールとデータベースの構築
H-Invitationalの歴史
2002年3月3-5日
第1回H-Invitational準備委員会
2002年5月17日
戦略ミーティング
2002年6月24-28日
第2回H-Invitationalの準備委員会 (統一規準の決定)
2002年8月25日-9月3日
H-Invitational (お台場マラソン)
2003年11月10-15日
第2回H-Invitational機能アノテーション会議
H-Invitationalに参加した機関
全44機関、12カ国 （順不同）
- 日本 (19)
-
産業技術総合研究所・生物情報解析研究センター
(社)バイオ産業情報化コンソーシアム・生物情報解析研究センター
(財)かずさDNA研究所
日本原子力研究所
理化学研究所
産業技術総合研究所・生命情報科学研究センター
国立遺伝学研究所生命情報・DDBJ研究センター
国立感染症研究所
東京大学
京都大学
東京医科歯科大学
大阪大学
慶応大学
東京工業大学
名古屋大学
九州大学
(株)リバース・プロテオミクス研究所
(株)日立製作所・中央研究所
大正製薬(株)
- アメリカ (9)
-
米国エネルギー省（DOE）
タイガー研究所（TIGR）
ウィスコンシン医科大学（Medical College of Wisconsin）
ローレンス・バークレー国立研究所（Lawrence Berkeley National Laboratory）
米国国立ガン研究所（National Cancer Institute）
国立バイオテクノロジー情報センター(NCBI)
ペンシルバニア大学（The Pennsylvania State University）
シンシナチ大学（University of Cincinnati）
アイオア大学（University of Iowa）
- 英国 (4)
-
欧州生命情報学研究所 （European Bioinformatics Institute）
HUGO(The Human Genome Organization Gene Nomenclature Committee)
サンガー研究所（Sanger Institute）
ロンドン大学 ユニバーシティー・カレッジ（University College London）
- ドイツ (3)
-
ドイツがん研究センター（German Resource Center for Genome Research、German Cancer Research Center）
MIPS (Munich Information Center for Protein Sequences）
- スウェーデン (2)
-
カロリンスカ研究所（Karolinska Institute）
スウェーデン王立工科大学（Royal Institute of Technology）
- フランス (1)
- フランス国立科学研究センター（Centre National De La Recherche Scientifique）
- 中国 (1)
- 中国上海ゲノムセンター （Chinese National Human Genome Center）
- 韓国 (1)
- 韓国生命工学研究所（Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology）
- ブラジル (1)
- ラドウィッグ癌研究所（Ludwig Institute of Cancer Research）
- オーストラリア (1)
- マードック大学（Murdoch University）
- 南アフリカ共和国 (1)
- 南アフリカ生物情報研究所（South African Bioinformatics Institute）
- スイス (1)
- スイス・バイオインフォマティクス研究所（Swiss Institute of Bioinformatics）
H-Invitational データセット
| 提供機関 |
項目数 |
| KDRI |
2,031 |
| FLJ*/KDRI |
397 |
| FLJ/IMSUT |
6,374 |
| FLJ/HRI |
22,047 |
| DKFZ/MIPS |
9,212 |
| MGC/NIH |
15,600 |
| CHGC |
758 |
| 合計: |
56,419 |
- 合計56,419のcDNAsが集められた。
- 6つの研究所およびDDBJとで2003年9月1日にデータ凍結を行なった。
- NCBIは最新ゲノムアセンブリ(build34)を提供した。
- EBIは非冗長なSWISSPROT/TrEMBLタンパク質セットを提供した。
- *日本の完全長cDNAプロジェクトからの提供
助成金謝辞:
- JBIC (バイオ産業情報化コンソーシアム)
- 生物情報解析研究センター （JBIRC/BIRC）
- 生物情報解析研究センター （産総研）BIRC/AIST
- 経済産業省 （日本）
- アメリカ国立衛生研究所 (NIH, アメリカ合衆国)
- アメリカ合衆国エネルギー省 (DOE, アメリカ合衆国
- CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique, フランス)
- DKFZ (Molecular Genome Analysis German Cancer Research Center、ドイツ)
- MIPS (Munich Information Centre for Protein Sequences、ドイツ)
Affiliations for authors:
- Integrated Database Group, Biological Information Research Center, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Waterfront Bio-IT Research Bldg. 7F, 2-42 Aomi, Koto-ku, 135-0064, Japan;
- Human Genome Center, The Institute of Medical Science, The University of Tokyo, 4-6-1 Shirokane-dai, Minato-ku Tokyo 108-8639, Japan;
- EMBL Outstation - European Bioinformatics Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Cambridge, CB10 1SD, United Kingdom;
- Center for Information Biology and DNA Data Bank of Japan, National Institute of Genetics, 1111 Yata, Mishima, Shizuoka 411-8540, Japan;
- Integrated Database Group, Japan Biological Information Research Center, Japan Biological Informatics Consortium, Waterfront Bio-IT Research Bldg. 7F, 2-42 Aomi, Koto-ku, 135-0064, Japan;
- BITS Co., Ltd., 537-1-103 Namiki, Yata, Mishima 411-0801, Japan;
- Functional Genomics Group, Biological Information Research Center, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 2-41-6 Aomi, Koto-ku, Tokyo 135-0064, Japan;
- Quantum Bioinformatics Group, Center for Promotion of Computational Science and Engineering, Japan Atomic Energy Research Institute, 8-1 Umemidai, Kizu-cho, Souraku-gun, Kyoto 619-0215, Japan;
- Reverse Proteomics Research Institute, 2-6-7 Kazusa-kamatari, Kisarazu, Chiba 292-0812, Japan;
- Central Research Laboratory, Hitachi, Ltd., 1-280 Higashi-koigakubo, Kokubunji-shi, Tokyo 185-8601, Japan;
- Bioinformatics Center, Institute for Chemical Research, Kyoto University, Gokasho, Uji, Kyoto 611-0011, Japan;
- CNRS, Laboratorie de Physique Mathematique, 34 Montpellier, France;
- National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institute of Health, 8600 Rockville Pike Bethesda, MD 20894, USA;
- The Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridge CB10 1SA, United Kingdom;
- National Cancer Institute, National Institute of Health, 31/10A07, 9000 Rockville Pike, Bethesda, MD 20892-2580, USA;
- Medical College of Wisconsin, 8701 Watertown Plank Road Milwaukee, WI 53226 USA;
- Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, P.O. Box 115, Yusong, Taejeon, 305-600, Korea;
- Sino-French Laboratory in Life Sciences and Genomics, 197 Rui-Jin Er Road, Shanghai 200025, China;
- MIPS-Institute for Bioinformatics at GSF-National Research Center for Environment and Health, Ingolstädter Landstraβe 1 D-85746 Neuherberg, Germany;
- Centre for Bioinformatics and Biological Computing School of Information Technology Murdoch University, Murdoch Western Australia 6150;
- The University of Iowa, MEBRF Iowa City, IA 52242 USA;
- Laboratory for Genome Exploration Research Group, RIKEN Genomic Sciences Center, RIKEN Yokohama Institute, 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan;
- Genome Science Laboratory, RIKEN, 2-1 Hirosawa, Wako-shi, Saitama 351-0198, Japan;
- Ludwig Institute of Cancer Research, Rua Prof. Antonio Prudente, 109 - 4, Andar 01509-010 Sao Paulo, SP, Brazil;
- Genexpress - CNRS - Functional Genomics and Systemic Biology for Health and LORIA, FRE 2571, 7, rue Guy Moquet, BP8, 94801 Villejuif Cedex, France;
- Swiss Institute of Bioinformatics, CMU - 1, rue Michel-Servet, CH - 1211 Geneva 4, Switzerland;
- Chinese National Human Genome Center at Shanghai, 250 Bi-Bo Road Zhangjiang High-tech Park Shanghai 201203 China;
- Graduate School of Frontier Sciences, Department of Integrated Biosciences, The University of Tokyo, 5-1-5 Kashiwanoha, Kashiwa-shi, Chiba 277-8562, Japan;
- Department of Primary Care and Population Sciences and the Institute of Child Health, University College London, The Holborn Union Building, Whittington Campus, Highgate Hill, London N19 3UA, U.K.;
- South African National Bioinformatics Institute, University of the Western Cape, Private Bag X17, Bellville, WP 7535 South Africa;
- Kazusa DNA Research Institute, 2-6-7 Kazusa-Kamatari, Kisarazu-shi, Chiba 292-0812, Japan;
- Molecular Genome Analysis German Cancer Research Center - DKFZ, Im Neuenheimer Feld 505 D-69129 Heidelberg Germany;
- The Pennsylvania State University, University Park, PA 16802;
- Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University, 1-3 Machikaneyama-cho, Toyonaka-shi, Osaka 560-8531, Japan;
- Department of Molecular Biology, Keio University School of Medicine, 35 Shinanomachi, Shinjuku-ku, Tokyo 160-8582, Japan;
- Computational Biology Research Center, Waterfront Bio-IT Research Bldg. 10F, 2-42 Aomi, Koto-ku, 135-0064, Japan
- Dept. Population Genetics, National Institute of Genetics, 1111 Yata, Mishima, Shizuoka 411-8540, Japan;
- Tokyo Research Laboratories, Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd, 3-6-6 Asahi-machi, Machida-shi, Tokyo 194-8533, Japan;
- National Institutes of Health National Center for Biotechnology Info., Bldg. 38A, Room 8N805 8600 Rockville Pike Bethesda, MD 20894 USA;
- Human Genome Research Group, Genomic Sciences Center, RIKEN Yokohama Institute, 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan;
- US Department of Energy Office of Biological & Environmental Research Biology Division & Genome Task Group, SC-72/Germantown Building, 1000 Independence Avenue, SW, Washington, D.C. 20585-1290 USA;
- The Institute for Genomic Research, 9712 Medical Center Drive Rockville, Maryland 20850, USA;
- Center for Genome Information, Department of Environmental Health, University of Cincinnati, 110 Kettering Laboratory, 3223 Eden Avenure, Cincinnati, OH 45267-0056, USA;
- Shanghai Institute of Hematology, Rui-Jin Hospital, affiliated to Shanghai Second Medical University, 197 Rui-Jin Road, Shanghai, 200025 China;
- Department of Genetics, The Graduate University for Advanced Studies, 1111 Yata, Mishima. Shizuoka 411-8540, Japan;
- Department of Genetics, General and Molecular Biology University, The University of Naples "Federico II", via Mezzocannone 8, 80134 Naples, Italy;
- Department of Molecular Genetics, Weizmann Institute of Science, Weizmann Institute of Science, 76100 Rehovot, Israel;
- Medical Photobiology Department, Photon Medical Research Center, Hamamatsu University School of Medicine, 1-20-1 Handayama, Hamamatsu-shi Shizuoka 431-3192;
- Founder, V.P. of Business Development POINTONE Systems 10437 Innovation Drive Wauwatosa, Wisconsin 53226-4815, USA;
- Nara Institute of Science and Technology (NAIST) 8916-5 Takayama-cho, Ikoma-shi, Nara 630-0192, Japan;
- Faculty of Bio-Science, Nagahama Institute of Bio-Science and Technology, Tamura-cho 1,266, Nagahama, Shiga 526-0829, Japan;
- Kyowa Hakko Kogyo, Tokyo Research Laboratory, 3-6-6 Asahi-machi, Machida, Tokyo 194-8533, Japan;
- State Key Laboratory of Medical Genomics, Shanghai Institutes for Biological Sciences, CAS, 197 Ruijin Road II, Education/Research Building, Room 705, Shanghai, 200025, China;
- Shanghai BioChip Co., Ltd, 646 Songtao Rd, Zhangjiang Hi-Tech Park, Shanghai, 201203, China;
- Department of Biological Sciences Idaho State University, Campus Box 8007, Idaho State University, Pocatello, ID 83209-8007, USA;
1.1.2 H-Invitational 2
H-Invitationalデータセット２として新しい洗練されたアノテーションを行うために、機能アノテーション会議を2003年11月10日- 15日に催した。
目的
ヒト遺伝子の機能アノテーション標準手続きの確立。
ヒト完全長cDNAに付与する機能アノテーションの更新。
将来の科学研究の「種」の発見。
資源提供
完全長cDNA
ヒトゲノムデータベース
タンパク質の配列と構造データ
マウス完全長cDNAプロジェクト
関連論文
研究組織
更新日：2007年3月30日